MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Herminiimonas arsenicoxydans chromosome

Total Repeats: 64444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009138	CGC	2	6	327	332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
2	NC_009138	CGC	2	6	363	368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
3	NC_009138	GCC	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
4	NC_009138	CGG	2	6	537	542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
5	NC_009138	CGA	2	6	571	576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093295
6	NC_009138	CGC	2	6	627	632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
7	NC_009138	GCG	2	6	710	715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
8	NC_009138	AAT	2	6	731	736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093295
9	NC_009138	GGC	2	6	770	775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
10	NC_009138	CGA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093295
11	NC_009138	TTA	2	6	928	933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093295
12	NC_009138	TTG	2	6	947	952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134093295
13	NC_009138	GAC	2	6	959	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093295
14	NC_009138	GGC	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
15	NC_009138	CGCA	2	8	989	996	25 %	0 %	25 %	50 %	134093295
16	NC_009138	GAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093295
17	NC_009138	TTC	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134093295
18	NC_009138	ATTG	2	8	1024	1031	25 %	50 %	25 %	0 %	134093295
19	NC_009138	ATC	3	9	1046	1054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093295
20	NC_009138	GAAA	2	8	1072	1079	75 %	0 %	25 %	0 %	134093295
21	NC_009138	GCC	2	6	1141	1146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
22	NC_009138	A	6	6	1178	1183	100 %	0 %	0 %	0 %	134093295
23	NC_009138	CGA	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093295
24	NC_009138	T	6	6	1223	1228	0 %	100 %	0 %	0 %	134093295
25	NC_009138	CGTG	2	8	1252	1259	0 %	25 %	50 %	25 %	134093295
26	NC_009138	AAG	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093295
27	NC_009138	CG	3	6	1465	1470	0 %	0 %	50 %	50 %	134093295
28	NC_009138	A	6	6	1512	1517	100 %	0 %	0 %	0 %	134093295
29	NC_009138	CGG	2	6	1543	1548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093295
30	NC_009138	GCC	2	6	1589	1594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093295
31	NC_009138	TGA	3	9	1658	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093295
32	NC_009138	GCT	2	6	2035	2040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
33	NC_009138	CA	3	6	2081	2086	50 %	0 %	0 %	50 %	134093296
34	NC_009138	TTTC	2	8	2133	2140	0 %	75 %	0 %	25 %	134093296
35	NC_009138	CAC	2	6	2167	2172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093296
36	NC_009138	GCAC	2	8	2173	2180	25 %	0 %	25 %	50 %	134093296
37	NC_009138	CGA	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093296
38	NC_009138	TGC	2	6	2218	2223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
39	NC_009138	GC	3	6	2245	2250	0 %	0 %	50 %	50 %	134093296
40	NC_009138	GGC	2	6	2341	2346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093296
41	NC_009138	GAA	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093296
42	NC_009138	A	6	6	2406	2411	100 %	0 %	0 %	0 %	134093296
43	NC_009138	GCA	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093296
44	NC_009138	CTG	3	9	2483	2491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
45	NC_009138	CG	3	6	2575	2580	0 %	0 %	50 %	50 %	134093296
46	NC_009138	TCA	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093296
47	NC_009138	CTG	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
48	NC_009138	GTG	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093296
49	NC_009138	AAC	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093296
50	NC_009138	CTG	2	6	2798	2803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
51	NC_009138	GC	3	6	2815	2820	0 %	0 %	50 %	50 %	134093296
52	NC_009138	CAT	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093296
53	NC_009138	GCA	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093296
54	NC_009138	GAA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093296
55	NC_009138	GAA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093296
56	NC_009138	CGG	2	6	2941	2946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093296
57	NC_009138	CTG	2	6	2981	2986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
58	NC_009138	AAC	2	6	2996	3001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093296
59	NC_009138	ACA	2	6	3012	3017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093296
60	NC_009138	CGT	2	6	3088	3093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093296
61	NC_009138	CCG	2	6	3374	3379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093297
62	NC_009138	AGC	2	6	3390	3395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093297
63	NC_009138	ACA	2	6	3473	3478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
64	NC_009138	CAG	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
65	NC_009138	TCCA	2	8	3523	3530	25 %	25 %	0 %	50 %	134093298
66	NC_009138	TCGA	2	8	3637	3644	25 %	25 %	25 %	25 %	134093298
67	NC_009138	CTCGAT	2	12	3699	3710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134093298
68	NC_009138	GAC	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
69	NC_009138	AGCGC	2	10	3770	3779	20 %	0 %	40 %	40 %	134093298
70	NC_009138	GGC	2	6	3811	3816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
71	NC_009138	CGG	2	6	3846	3851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
72	NC_009138	CGTG	2	8	3872	3879	0 %	25 %	50 %	25 %	134093298
73	NC_009138	TGA	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093298
74	NC_009138	CAA	2	6	4074	4079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
75	NC_009138	TCCT	2	8	4126	4133	0 %	50 %	0 %	50 %	134093298
76	NC_009138	CAA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
77	NC_009138	GAA	2	6	4180	4185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093298
78	NC_009138	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
79	NC_009138	CG	3	6	4208	4213	0 %	0 %	50 %	50 %	134093298
80	NC_009138	CAA	2	6	4230	4235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
81	NC_009138	CGA	2	6	4256	4261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
82	NC_009138	ACG	2	6	4334	4339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
83	NC_009138	CAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
84	NC_009138	CGG	2	6	4389	4394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
85	NC_009138	CACC	2	8	4395	4402	25 %	0 %	0 %	75 %	134093298
86	NC_009138	GC	3	6	4413	4418	0 %	0 %	50 %	50 %	134093298
87	NC_009138	CG	3	6	4427	4432	0 %	0 %	50 %	50 %	134093298
88	NC_009138	TCA	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
89	NC_009138	CGA	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
90	NC_009138	A	6	6	4468	4473	100 %	0 %	0 %	0 %	134093298
91	NC_009138	CGA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
92	NC_009138	TCG	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
93	NC_009138	ACG	2	6	4655	4660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
94	NC_009138	ATC	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
95	NC_009138	CG	7	14	4692	4705	0 %	0 %	50 %	50 %	134093298
96	NC_009138	TCG	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
97	NC_009138	CGGCCT	2	12	4755	4766	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134093298
98	NC_009138	CTC	2	6	4767	4772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134093298
99	NC_009138	GGC	2	6	4843	4848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
100	NC_009138	GC	3	6	4924	4929	0 %	0 %	50 %	50 %	134093298
101	NC_009138	A	6	6	4934	4939	100 %	0 %	0 %	0 %	134093298
102	NC_009138	CAC	2	6	4959	4964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093298
103	NC_009138	ACC	2	6	5027	5032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093298
104	NC_009138	ATC	3	9	5035	5043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
105	NC_009138	CTG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
106	NC_009138	GCT	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
107	NC_009138	CCG	2	6	5152	5157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093298
108	NC_009138	GAT	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093298
109	NC_009138	GAA	2	6	5209	5214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134093298
110	NC_009138	ATG	2	6	5224	5229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134093298
111	NC_009138	ACG	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
112	NC_009138	CCG	2	6	5261	5266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093298
113	NC_009138	GCG	2	6	5285	5290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093298
114	NC_009138	ACA	2	6	5318	5323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
115	NC_009138	CAT	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
116	NC_009138	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093298
117	NC_009138	CAT	2	6	5382	5387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134093298
118	NC_009138	ACG	2	6	5492	5497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
119	NC_009138	CATC	2	8	5523	5530	25 %	25 %	0 %	50 %	134093298
120	NC_009138	GCC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093298
121	NC_009138	CCA	2	6	5703	5708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134093298
122	NC_009138	AGC	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
123	NC_009138	AAC	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134093298
124	NC_009138	CGA	2	6	5892	5897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093298
125	NC_009138	CGT	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
126	NC_009138	ATTGA	2	10	5920	5929	40 %	40 %	20 %	0 %	134093298
127	NC_009138	CTG	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134093298
128	NC_009138	T	6	6	6017	6022	0 %	100 %	0 %	0 %	134093299
129	NC_009138	T	6	6	6027	6032	0 %	100 %	0 %	0 %	134093299
130	NC_009138	T	6	6	6082	6087	0 %	100 %	0 %	0 %	134093299
131	NC_009138	TA	3	6	6092	6097	50 %	50 %	0 %	0 %	134093299
132	NC_009138	TGG	2	6	6104	6109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134093299
133	NC_009138	ATTTTA	2	12	6125	6136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134093299
134	NC_009138	T	7	7	6170	6176	0 %	100 %	0 %	0 %	134093299
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138	NC_009138	TGTA	2	8	6399	6406	25 %	50 %	25 %	0 %	134093299
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264	NC_009138	GGA	2	6	13906	13911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134093308
265	NC_009138	CGG	2	6	13926	13931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093308
266	NC_009138	GC	3	6	14021	14026	0 %	0 %	50 %	50 %	134093308
267	NC_009138	GC	3	6	14095	14100	0 %	0 %	50 %	50 %	134093308
268	NC_009138	CAGG	2	8	14155	14162	25 %	0 %	50 %	25 %	134093308
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271	NC_009138	CGA	2	6	14256	14261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093308
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300	NC_009138	A	6	6	15569	15574	100 %	0 %	0 %	0 %	134093309
301	NC_009138	GCG	2	6	15602	15607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134093309
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378	NC_009138	GT	3	6	20972	20977	0 %	50 %	50 %	0 %	134093314
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382	NC_009138	GCA	2	6	21171	21176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134093314
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391	NC_009138	CGC	2	6	21490	21495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134093314
392	NC_009138	AAT	2	6	21507	21512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134093314
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